หลังจาก ปิดฤดูกาล 2011 ด้วยอันดับ 16 จาก 18 ทีม ในศึก เอไอเอส ลีก 2011 ทำให้ ปทุมธานี FC. ต้องเปลี่ยนระบบการทำทีมใหม่ ตั้งแต่ระดับบริหาร จนถึง ผู้ฝึกสอน และนักฟุตบอล ซึ่งได้รับการสนับสนุนงบประมาณจาก การประปานครหลวง กว่า 3 ล้าน และเปลี่ยนโลโก้ ของทีมเสียใหม่ จากเดิม รูปนกปากห่าง เป็น มังกรคะนองศึก เพื่อให้สอดคล้องและถือเป็นสิ่งนำโชค ให้กับพี่น้องชาวปทุมธานี แฟนคลับ ต่างๆ ยังไงติดตามความคืบหน้าของทีมต่อไป.